Planetě Krypton hrozí bezprostřední zkáza kvůli nestabilnímu jádru a její vládnoucí rada je ohrožena povstaleckým generálem Zodem a jeho stoupenci. Vědec Jor-El a jeho žena Lara-El tajně vtisknou genetický kód do buněk svého novorozeného syna Kal-Ela a vyšlou ho na vesmírnou loď na Zemi, aby zachránili kryptonskou rasu. Poté, co Zod Jor-Ela zavraždí, je spolu se svými stoupenci vyhnán do Zóny přízraků, ale podaří se jim uniknout, když Krypton exploduje. Nemluvně Kal-El přistane na Zemi ve Smallville v Kansasu, kde ho objeví manželé Jonathan a Martha Kentovi, kteří ho pojmenují Clark a vychovávají ho jako svého adoptivního syna.
Clarkova kryptonská fyziologie mu na Zemi propůjčuje nadlidské schopnosti. Mladý Clark se postupně učí zdokonalovat schopnosti, které mu zpočátku působí zmatek a nepohodlí. Jonathan dospívajícímu Clarkovi prozradí, že je mimozemšťan, a poradí mu, aby své schopnosti nevyužíval veřejně, protože se obává, že by ho společnost zavrhla. Po Jonathanově smrti stráví dospělý Clark několik následujících let kočovným způsobem života, kdy pod falešnými jmény pracuje v různých zaměstnáních, aby zahladil stopy a skryl svou identitu. Nakonec objeví kryptonskou průzkumnou loď s technologií, která mu umožňuje komunikovat s vědomím Jor-Ela v podobě hologramu. Lois Laneová, novinářka z Daily Planet, držitelka Pulitzerovy ceny, loď při pátrání po článku také objeví a Clark ji zachrání, když je zraněna. Loisin šéfredaktor Perry White její příběh o "nadlidském" zachránci odmítne, a tak se vydává po Clarkových stopách do Smallville s úmyslem napsat o něm odhalení. Poté, co si vyslechne jeho příběh, se rozhodne, že jeho tajemství neprozradí.
Když Zod objeví průzkumnou loď, vydá se na Zemi, kde požaduje, aby se mu Kal-El vzdal, jinak lidstvo ponese následky. Clark souhlasí, že se vzdá americké armádě, která předá Lois a Clarka Zodově zástupkyni Faoře. Zod odhalí, že má v úmyslu pomocí terraformačního "světového motoru" přeměnit Zemi na planetu podobnou Kryptonu, vyhladit lidskou populaci a pomocí kodexu znovu osídlit planetu geneticky upravenými Kryptoňany. Poté, co Clark a Lois uniknou z lodi, Clark ve Smallville porazí Faoru a dalšího ze Zodových přisluhovačů a přesvědčí armádu, že je na jejich straně. Zod nasadí světový motor a zahájí terraformaci v Metropolis a nad Indickým oceánem.
Clark, nyní přezdívaný "Superman", zastaví světový motor v Indickém oceánu. Armáda použije vesmírnou loď, která Supermana přivezla na Zemi, k leteckému útoku a vytvoří portál, který vrátí Zodovu loď a jeho posádku do Zóny přízraků. Zůstává pouze Zod, který se se Supermanem pustí do vzájemného souboje. Po bitvě je Superman nucen Zoda zabít, aby zachránil skupinu nevinných civilistů, které se Zod pokusí zavraždit. Superman se rozhodne splynout se společností tím, že nosí brýle, chová se mírně a obnoví svou identitu Clarka Kenta. White ho najme, aby pracoval jako reportér pro Daily Planet.