Vrozený imunitní systém brání hostitele před infekcemi. Zahrnuje buňky, které rozpoznávají patogeny (choroboplodné zárodky) a okamžitě na ně reagují. Odpověď vrozeného imunitního systému není specifická: reaguje stejně na všechny patogeny, které rozpozná.

Na rozdíl od adaptivního imunitního systému neposkytuje vrozený imunitní systém dlouhodobou imunitu proti specifickým infekcím.

Vrozený imunitní systém poskytuje okamžitou obranu proti infekci a vyskytuje se u všech rostlin a živočichů. Vrozený systém je evolučně starší obranná strategie. Je to hlavní imunitní systém, který se vyskytuje u rostlin, hub, hmyzu a u primitivních mnohobuněčných organismů. Tento systém není přizpůsobivý a v průběhu života jedince se nemění.

Vrozený imunitní systém obratlovců: