O tom, že se stane prezidentem, Truman řekl: Truman řekl: "Měl jsem pocit, jako by na mě spadl měsíc, hvězdy a všechny planety."
Truman se stal prezidentem během posledních měsíců druhé světové války. V době, kdy byl Truman viceprezidentem, mu Roosevelt o druhé světové válce nikdy příliš neřekl. V té době lidé nepovažovali funkci viceprezidenta za důležitou funkci v politice. Z tohoto důvodu Truman nastoupil do prezidentského úřadu a o tom, co americká armáda ve druhé světové válce dělala, nevěděl o mnoho více než průměrný člověk.
Nacistické Německo kapitulovalo necelý měsíc poté, co se Truman stal prezidentem. Tím skončila válka v Evropě. Japonci však bojovali dál. Spojenci za druhé světové války přijali Postupimskou deklaraci, v níž Japonsku řekli, aby se vzdalo, jinak bude čelit "rychlému a úplnému zničení". Japonsko se nevzdalo, a tak Truman 6. srpna 1945 nařídil svržení první atomové bomby na japonskou Hirošimu. O tři dny později Truman nařídil svržení druhé atomové bomby na japonské Nagasaki. Japonsko kapitulovalo a válka skončila.
Obrovská ničivá síla atomových bomb srovnala obě města se zemí a zabila více než sto tisíc lidí, přičemž mnoho dalších zemřelo v následujících letech na nemoci způsobené ozářením. Lidé, kteří s rozhodnutím nesouhlasili, jako například generál a budoucí prezident Dwight Eisenhower, se domnívají, že šlo o krutý a nelidský útok na nevinné lidi, když už bylo Japonsko téměř poraženo. Jiní lidé si mysleli, že to bylo dobré rozhodnutí, protože předčasně ukončilo válku. Truman se domníval, že kdyby USA místo použití bomb napadly Japonsko a rychle ukončily válku, zemřelo by mnohem více Američanů.
Po válce
Po válce Truman nařídil opravit Evropu (která byla během války zničena) pomocí Marshallova plánu. Německo bylo po válce rozděleno na dvě části. Východní Německo ovládl Sovětský svaz. Spojené státy, Velká Británie a Francie kontrolovaly západní Německo. Během sovětské blokády Západního Berlína nařídil Truman letecký most do Berlína, v jehož rámci byly do Západního Německa dopraveny tuny potravin, aby se hladovějící lidé najedli.
Truman se také podílel na založení Organizace spojených národů, organizace, která vycházela ze Společnosti národů. Organizace spojených národů existuje dodnes. Jejím cílem je, aby různé země spolupracovaly na pomoci lidstvu a na podpoře míru.
Po druhé světové válce zůstaly Sovětský svaz a Spojené státy jako jediné dvě mocné země. S rozdělením Německa mezi Sovětský svaz a Spojené státy začalo mezi oběma zeměmi narůstat napětí. Začala studená válka. Jednalo se o válku, ve které Sovětský svaz a Spojené státy přímo nebojovaly, ale každá z nich chtěla mít nad světem větší vliv než ta druhá. Sovětský svaz chtěl rozšířit komunismus po celém světě. (Komunismus je přesvědčení, že vláda by měla vlastnit ekonomiku, aby si všichni byli rovni). Truman věřil v politiku zvanou zadržování: USA měly zadržovat komunismus a zabránit jeho šíření. Truman vyhlásil Trumanovu doktrínu, podle níž měly Spojené státy poskytnout peníze Turecku a Řecku, aby byly dostatečně silné a mohly se bránit komunismu.
Truman poslal Kongresu svůj "Fair Deal". Ten vycházel z Rooseveltova New Dealu. Dával více peněz na vzdělání, více peněz zemědělcům a vyšší minimální mzdu pro dělníky. Odboroví předáci ho žádali o vyšší mzdy a větší výhody.
Po stávce horníků Truman nechal převzít doly ministerstvem vnitra. Truman sice sympatizoval s dělnickou třídou, ale když došlo k obrovské stávce na železnici, Truman ji považoval za nezákonnou. Považoval to také za nespravedlivé vůči lidem, kteří se nemohli dostat do práce, protože železnice nejezdily. Reagoval tak, že stávkujícím pohrozil, že pokud se nevrátí do práce, budou muset jít do armády.
Truman zrušil segregaci v armádě a umožnil černochům a bělochům bojovat společně.
V roce 1948 se Truman ucházel o druhé prezidentské období proti Thomasi Deweymu. Byl outsiderem a všichni si mysleli, že prohraje. List Chicago Tribune vydal v noc voleb noviny s titulkem "Dewey poráží Trumana". K překvapení všech Harry Truman volby vyhrál.
Korejská válka
25. června 1950 zaútočila Severní Korea na Jižní Koreu. Čína Severní Koreu podpořila. Severní Korea chtěla do Jižní Koreje zavést komunismus.
Spojené státy vedly korejskou válku, aby bránily Jižní Koreu a zabránily šíření komunismu v této zemi. Generál Douglas MacArthur chtěl bombardovat Čínu. Truman to považoval za příliš nebezpečné, a tak MacArthura vyhodil. Mnoho lidí si MacArthura vážilo, a proto se na Trumana zlobili. Ten jmenoval generálem Mathewa B. Ridgewaye.
Na konci svého funkčního období byl Harry Truman na historickém minimu. Byl velmi nepopulární, protože v korejské válce zahynuly tisíce Američanů, v jeho vládě byla středně velká korupce a lidé obviňovali mnoho Trumanových zaměstnanců z toho, že jsou komunisté. Z úřadu odešel 20. ledna 1953. Korejská válka skončila asi o šest měsíců později.
Postupem času se Trumanova pověst zlepšovala. Mnoho historiků se dnes domnívá, že Harry Truman byl skvělým prezidentem.