SSRI se používají především k léčbě:
Deprese
Antidepresiva jako SSRI jsou lékem první volby pro lidi s velmi těžkou depresí. Pokud deprese není tak silná, ale poradenství člověku nepomohlo, mohou mu pomoci antidepresiva.
Vědci se neshodují, zda SSRI fungují u mírných depresí, které netrvají příliš dlouho.
Úzkostné poruchy
SSRI dobře fungují při generalizované úzkostné poruše. Pomáhají snižovat úzkost. To jim může pomoci účastnit se poradenství a naučit se, jak se s úzkostí vypořádat.
SSRI také dobře působí při obsedantně-kompulzivní poruše (OCD). Jsou lékem první volby pro osoby s velmi těžkou OCD. Stejně jako u deprese a generalizované úzkostné poruchy nejsou SSRI lékem; lidé se musí účastnit také poradenství a dalších léčebných postupů. Lidé s OCD, kteří užívali SSRI, však mají přibližně dvakrát vyšší pravděpodobnost, že se jim bude při léčbě dařit, než lidé, kteří SSRI neužívají.
Fluoxetin (Prozac) a paroxetin (Paxil) jsou jediné léky, které americký Úřad pro kontrolu potravin a léčiv schválil pro léčbu posttraumatické stresové poruchy (PTSD). Samotné léky obvykle PTSD nevyléčí; je třeba je kombinovat s poradenstvím. S výjimkou Prozacu a Paxilu se zdá, že většina ostatních SSRI na PTSD nepomáhá.
Poruchy příjmu potravy
Když se člověk začne léčit s nervovou bulimií nebo poruchou příjmu potravy, mohou být SSRI užitečným prvním krokem. Během krátké doby mohou zmírnit některé příznaky těchto poruch příjmu potravy. Například po krátkou dobu lidé užívající SSRI méně jedí záchvatovitě. Zdá se však, že SSRI pomáhají pouze po krátkou dobu.
Zdá se, že SSRI nepomáhají při mentální anorexii. Pokud však člověk s anorexií trpí také depresí, úzkostí nebo OCD, mohou SSRI pomoci při léčbě těchto problémů.
Chronická bolest
Výzkum ukazuje, že dva SSRI mohou pomoci při léčbě chronické bolesti. Těmito SSRI jsou paroxetin (Paxil) a citalopram (Celexa). Ostatní SSRI, jako je fluoxetin (Prozac), na chronickou bolest nepomáhají.
Další skupina antidepresiv, tzv. tricyklická antidepresiva, léčí chronickou bolest lépe než SSRI. Tricyklická antidepresiva však mají mnohem více nežádoucích účinků než SSRI. Z tohoto důvodu někteří lékaři předepisují na chronickou bolest paroxetin nebo citalopram, protože jejich nežádoucí účinky nejsou tak závažné.