Cope se vrátil domů do Filadelfie ještě před koncem občanské války. Oženil se se známou kvakerkou Annie Pimovou. Žila na farmě a svatba se konala v jejím domě.
Cope napsal práce o rybách, velrybách a jednu o fosilní žábě s ocasem. str.835 Copeův otec věnoval peníze malé kvakerské škole Haverford College. Tato vysoká škola udělila Copeovi čestný magisterský titul a najala ho, aby vyučoval zoologii. str. 48
Cope podnikal vědecké cesty na americký západ a během nich psal dopisy svým rodičům, manželce a dceři. Svému otci řekl, že vyučování mu zabírá příliš mnoho času na to, aby mohl dělat vědecké objevy. s143/6 Odešel z práce na univerzitě. S manželkou a dcerou se pak přestěhovali do Haddonfieldu, aby byli blíž nalezištím zkamenělin v západním New Jersey.
V Haddonfieldu v New Jersey se nacházely marlpity, kde William Foulke v roce 1858 objevil kostru dinosaura, kterou doktor Leidy z filadelfské Akademie přírodních věd pojmenoval Hadrosaurus foulkii. s151/8 Cope v marlpitech našel další zkameněliny. V roce 1868 například popsal Elasmosaurusplatyurus a Laelaps. Edward Cope se také vydával na expedice do jeskyní; poslední jeskyní, kterou navštívil, byly Wyandotte Caves v Indianě v roce 1871. s151/5
Ve svých 30 letech napsal kvaker mnoho vědeckých prací, které byly publikovány. Charles Sternberg uvedl, že na zkamenělinových polích v Kansasu měl Cope "těžký záchvat noční můry... každý živočich, po kterém jsme přes den našli stopu, si s ním v noci hrál... někdy v tomto vyčerpávajícím spánku promarodil půl noci". s167
Cope hledal zkameněliny také na západě Spojených států. V roce 1872 zkoumal eocénní horniny. Horniny byly staré 55 až 38 milionů let. Toho roku příliš pracoval a zhroutil se. s. 583 V roce 1873 studoval titanothérické vrstvy (strata) v severovýchodním Coloradu. Titanothere byl velký vyhynulý býložravec. str. 183/194
Průzkum společnosti Wheeler
V roce 1874 se Cope přihlásil do Wheelerova průzkumu. Tyto geologické mapovací cesty vedl George Montague Wheeler. Mapovali části Spojených států západně od 100. poledníku. p200 100. poledník na západě je hranicí mezi suchým západem a deštivým východem Spojených států.
V roce 1874 objevil Cope při Wheelerově průzkumu formaci Puerco v Novém Mexiku. p200 Formace Puerco byla vrstva měkkých hornin o mocnosti 500 stop podél horního toku řeky Puerco poblíž města Cuba v Novém Mexiku. Jednalo se o zelený a černý marl (který obsahoval chemické látky používané při výrobě hnojiv). Později někdo našel zkameněliny v podobné formaci západně odtud v jiném okrese. Cope řekl, že to vypadá, jako by tyto zkameněliny pocházely z jeho formace Puerco, kterou objevil. Jeho útes možná vyhloubila řeka za dlouhou dobu a vypadalo to, že tam byl dlouho. Bylo to něco, co vědci, které znal, před ním neviděli. Jako součást Wheelerova průzkumu mohl nakupovat v komisařstvích. Svůj nález mohl dostat do zpráv, které průzkum zveřejňoval. Na jednu cestu průzkumu vzal s sebou manželku a dceru a pronajal jim dům. Jako dobrovolník si cestu platil sám. str. 63
Nezávislost
Když bylo Copeovi 35 let, jeho otec zemřel a zanechal mu čtvrt milionu dolarů. p837 Následujícího roku 1876 se Cope přestěhoval se svou ženou a dcerou z domu u jablečného sadu v Haddonfieldu v New Jersey zpět do Filadelfie v Pensylvánii - tentokrát do řadového domu ve městě. Koupil dvě bytové jednotky a tu vedlejší využíval jako paleolaboratoř pro svou sbírku zkamenělin. Přestal se věnovat terénní práci, aby dohnal, co se dá napsat. Najímal si týmy, které pro něj hledaly zkameněliny. A pomáhal filadelfské výstavě Centennial Exhibition s přípravou expozic zkamenělin. s218 V roce 1877 se mu podařilo koupit polovinu časopisu American Naturalist.
Publikoval práce tak rychle, že jeho konkurent, profesor Marsh, měl pochybnosti o tom, kdy byly Copeovy fosilie nalezeny. V srpnu 1878, když mu bylo 38 let, odplul Cope na Britské ostrovy, aby se zúčastnil vědeckého sjezdu v irském Dublinu. Poté odplul do Francie, aby se tam zúčastnil dvoudenního vědeckého sjezdu. Na jednom ze sjezdů se rozhodl koupit několik krabic argentinských zkamenělin, možná pro muzeum ve Filadelfii.
Když se Cope vrátil, čekaly ho dva roky sbírky od jeho člověka Lucase. Patřil k nim i camarasaurus, sauropod. str. 42