Srovnávací anatomie je vědecké porovnávání těl živočichů. Účelem srovnávací anatomie je zjistit jejich stavbu a rozhodnout o fylogenetických vztazích mezi různými skupinami živočichů. Rozdělení živočichů do fylů se provádí především pomocí srovnávací anatomie: viz Seznam živočišných fylů.
Hlavními používanými technikami jsou pitva a mikroskopie. Pitva je starobylá metoda, která se používá ke zjištění vnitřní struktury živého organismu (obvykle se provádí až po jeho smrti). Dodnes ji používají studenti medicíny k poznávání detailů lidského těla. Jednoduché mikroskopy byly poprvé vynalezeny v 17. století a složený mikroskop (používaný dodnes) se stal dostupným v 19. století. Účelem mikroskopie je umožnit nám vidět drobné detaily struktury. Často se také provádí pečlivé porovnávání velkých sbírek živočichů (obvykle v muzeích).
Velká éra srovnávací anatomie trvala přibližně od roku 1800 do roku 1950. Používali ji jak ti, kteří nevěřili v evoluci, jako například Georges Cuvier, tak ti, kteří v ni věřili, jako například Thomas Henry Huxley. Sám Charles Darwin používal srovnávací anatomii jako hlavní nástroj při své práci o sudokopytnících. V dnešní době je hlavní metodou používanou ke zjišťování příbuzenských vztahů molekulární evoluce, která využívá analýzu sekvence DNA. Pro mnohé výzkumné účely však zoologové stále pitvají zvířata. Chcete-li získat titul v oboru biologie, musíte znát stavbu živočichů (a rostlin).
