Teorii geografické mozaiky koevoluce vyvinul John N. Thompson jako rámec pro představu koevolučního procesu v reálných populacích a druzích. Byl to pokus o začlenění minimálních složek populační biologie potřebných pro ekologicky a evolučně realistickou teorii koevoluce a vyvíjejících se interakcí obecně. Vztahuje se na dvojice interagujících druhů, malé skupiny interagujících druhů a rozsáhlé sítě interakcí.
Předpoklady: Teorie geografické mozaiky je založena na několika pozorováních, která jsou biologům již dlouho známa. Tato pozorování jsou brána jako předpoklady při vývoji teorie geografické mozaiky:
1. Druhy jsou často soubory geneticky odlišných populací.
2. Vzájemně se ovlivňující druhy se často liší ve svém geografickém areálu.
3. interakce mezi druhy se v různých prostředích liší svými ekologickými výsledky.
Hypotéza: Na základě těchto předpokladů teorie geografické mozaiky tvrdí, že koevoluce probíhá prostřednictvím přírodního výběru působícího na tři zdroje variability, které ovlivňují interakce mezi druhy. Tyto tři zdroje variability lze formálně rozdělit jako interakce genotypu s genotypem a prostředí (GxGxE).
1. Mozaika geografického výběru: Struktura přírodního výběru na interakce se v různých prostředích liší (např. vysoké vs. nízké teploty, vysoké vs. nízké živiny; okolní druhově bohatá vs. druhově chudá síť). K těmto rozdílům dochází proto, že geny se v různých prostředích projevují různými způsoby (interakce GxE) a druhy si v různých prostředích navzájem ovlivňují fitness různými způsoby.
Například interakce může být v jednom prostředí antagonistická a v jiném prostředí mutualistická, nebo může být antagonistická ve všech prostředích, ale selekce může v různých prostředích zvýhodňovat různé znaky).
2. Koevoluční ohniska: Intenzita vzájemné selekce se v různých prostředích liší. Interakce podléhají vzájemné selekci pouze v rámci některých lokálních společenstev, kterým se říká koevoluční ohniska. Tyto koevoluční hotspoty jsou zasazeny do širší matice koevolučních coldspotů, kde místní přírodní výběr není reciproční nebo kde se vyskytuje pouze jeden z účastníků.
Například interakce může být v některých prostředích mutualistická nebo antagonistická (koevoluční hotspoty), ale v jiných prostředích komenzalistická (koevoluční coldspoty).
3. Remixování vlastností: Celková genetická struktura koevolučních druhů se neustále mění v důsledku nových mutací, genomických změn, toku genů mezi populacemi, rozdílného náhodného genetického driftu mezi populacemi a vymírání lokálních populací, které se liší kombinacemi koevolučních znaků, jež jsou jejich nositeli. Nový genetický materiál, na který může působit přírodní výběr, může být výsledkem jednoduchých genetických mutací, chromozomálních přestaveb, hybridizace mezi populacemi nebo duplikací celého genomu (polypoloidie). Tyto procesy přispívají k měnící se geografické mozaice koevoluce tím, že neustále mění prostorové rozložení potenciálně koevolučních genů a znaků.
Kombinace těchto procesů neustále mění rozložení genotypů v rámci každé místní populace a rozložení genotypů mezi populacemi.
POZNÁMKA: Některé popisy teorie geografické mozaiky tuto část teorie geografické mozaiky, která se týká "remixování znaků", převádějí na tok genů. To je nesprávná charakteristika. Smysl remixování znaků spočívá v tom, že kombinací genetických, genomických a ekologických procesů se dostupné rozložení koevolučních znaků, na které může působit přírodní výběr, v průběhu času stále mění v rámci populací i mezi nimi.
Ve studiích koevoluce lze na interakci GxGxE nahlížet buď formálně na úrovni genů nebo genotypů (tj. jak selekce působí na stejný gen nebo genotyp v různých kontrastních prostředích), nebo obecněji na úrovni toho, jak přírodní výběr působí na dva nebo více vzájemně se ovlivňujících druhů v mnoha kontrastních prostředích.
Viz knihy Johna N. Thompsona (1982 Interaction and Coevolution; 1994 The Coevolutionary Process; 2005 The Geographic Mosaic of Coevolution; 2013 Relentless Evolution).