První anglická občanská válka (1642-46)
V polovině roku 1642 začaly obě strany cestovat po zemi a shánět příznivce a zbraně. Dne 22. srpna vztyčil král Karel v Nottinghamu královskou vlajku. Tím oznámil, že je ve válce s parlamentem.
Král našel větší podporu na venkově, v chudších částech země a v severní a západní Anglii. Parlament měl větší podporu ve většině měst, v přístavech, bohatších částech země a v jižní a východní Anglii. Lidé, kteří byli tajně katolíky, většinou podporovali krále. Královské námořnictvo a většina puritánů podporovala parlament. Některé oblasti podporovaly Parlament kvůli místním problémům, například odvodňovací práce v oblasti The Fens.
V čele roajalistických vojsk stál princ Rupert, králův synovec. Parlamentní vojska zpočátku vedl hrabě z Essexu. Royalisté se rozhodli, že se pokusí s parlamentáři rychle bojovat, a proto se s nimi vydali vstříc do Warwickshiru. První velkou bitvou byla bitva u Edgehillu v říjnu 1642. Bitva skončila nerozhodně. Král se pokusil vrátit do Londýna, ale byl zablokován parlamentářskou armádou. Přesunul se se svými vojsky do Oxfordu, kde měl více loajálních stoupenců.
První rok války probíhal pro roajalisty poměrně dobře. Posílili svou kontrolu nad severem a západem, ale méně úspěšní byli ve Středozemí. Po polovině roku 1643 se parlamentářům začalo dařit lépe. Vyhráli bitvy v Lincolnshire, na východě a u Newbury západně od Londýna.
Král Karel se dohodl s irskými povstalci, že zastaví boje v Irsku a uvolní vojáky, kteří budou moci bojovat za něj. Parlament uzavřel dohodu se skotskými Covenantory, kteří jim měli pomoci. Parlamentu také pomohl talentovaný vůdce armády Oliver Cromwell. Ten vedl jednotku kavalerie (jezdců na koních) zvanou "Ironsides". Ironsides byli lépe organizovaní než většina jezdeckých jednotek, díky čemuž byli v boji mnohem lepší.
Za pomoci Skotů a železných jezdců dosáhl parlament v červenci 1644 významného vítězství v bitvě u Marston Moor. Získali kontrolu nad severní Anglií. Royalisté byli oslabeni, ale ještě ne poraženi. Zvítězili v bitvě u Lostwithielu v Cornwallu a porazili Essexovy vojáky. Podařilo se jim také vybojovat remízu ve druhé bitvě u Newbury v říjnu.
V roce 1645 parlament zorganizoval své vojáky do armády nového vzoru. Hraběte z Essexu nahradil sir Thomas Fairfax. Fairfaxovým zástupcem se stal Oliver Cromwell. Armáda nového modelu byla lépe organizovaná než jakákoli armáda před ní. V bitvě u Naseby v červnu 1645 porazila největší královskou armádu. Většina roajalistických vojáků u Naseby padla do zajetí. Král Karel z Naseby uprchl, ale zanechal zde svá zavazadla, v nichž byly dopisy. Parlamentáři je otevřeli a zjistili, že se král snaží získat pomoc od irských katolíků a z katolických zemí. Král kvůli tomu ztratil podporu.
Druhá hlavní roajalistická armáda byla o měsíc později poražena v bitvě u Langportu v Somersetu. Parlamentáři převzali kontrolu nad jihozápadní Anglií, kde byli slabí. Král Karel se snažil shromáždit své zbývající stoupence v Midlands. Mnoho pevnostních měst v oblasti od Oxfordu po Newark-on-Trent mu bylo stále věrných. V květnu 1646 se Karel setkal se skotskou armádou v Nottinghamshire. Skotové ho zajali.
Druhá anglická občanská válka (1648)
Přestože poslanci zvítězili, byli rozděleni v názoru na řízení země. Jeden z velkých sporů se týkal náboženství. Většina členů parlamentu chtěla presbyteriánskou národní církev. Nový model armády upřednostňoval, aby se místní církve řídily samy, aniž by existovala národní církev. Poražení roajalisté podporovali stávající anglikánskou církev, i když někteří z nich byli tajně katolíky. Parlament i armáda se snažily získat podporu krále a skotských presbyteriánů. Král Karel byl ve vězení a byl předáván mezi jednotlivými skupinami. Odmítal uzavřít dohodu s kteroukoli z nich, protože věřil, že pouze on má právo vládnout Anglii. Předstíral, že má zájem na uzavření dohody, zatímco plánoval převzít zpět vládu nad zemí. Rozpory se ještě zhoršily, když se parlament pokusil rozpustit armádu nového modelu.
Druhá válka vypukla, když se někteří skotští presbyteriáni (tzv. engagery) a někteří angličtí presbyteriáni spojili s králem. Dohodli se, že ho budou podporovat výměnou za to, že se anglické a skotské církve stanou presbyteriánskými církvemi. Skotové napadli Anglii, zatímco v různých částech Anglie vypukla roajalistická povstání. Některá povstání byla velmi snadno poražena. Povstání ve Walesu, Kentu, Essexu a Cumberlandu byla silnější, ale byla potlačena armádou nového modelu. Royalisté a Skotové byli poraženi v bitvě u Prestonu v srpnu 1648.
Poprava krále Karla I.
Armáda nového modelu měla vše pod kontrolou. Při akci zvané "Prideova čistka" odstranil armádní plukovník Thomas Pride všechny členy parlamentu, kteří nepodporovali armádu. Zůstalo jen několik málo 75 členů. Armáda je pověřila řízením země a tento parlament se nazýval Rump Parliament.
Rump parlament se rozhodl, že s králem Karlem již nebude spolupracovat. Postavili ho před soud. Soud ho 27. ledna 1649 shledal vinným z velezrady a označil ho za "tyrana, zrádce, vraha a veřejného nepřítele". O tři dny později byl sťat.
Mnoho historiků tvrdí, že poprava krále Karla byla důležitým okamžikem v anglických dějinách, a dokonce i v dějinách západního světa. Žádný evropský panovník předtím nebyl souzen vlastním lidem. Ostatní země v Evropě sice tvrdily, že poprava byla špatná, ale nic moc jiného neudělaly. Ne všichni poslanci popravu podporovali. Fairfax si myslel, že je to špatně. Rezignoval na funkci vůdce Nového modelu armády a nahradil ho Oliver Cromwell.
Dalším králem se měl stát Karlův syn princ Charles, budoucí král Karel II. Místo toho parlament oznámil, že se Anglie stane republikou, která se bude nazývat Anglické společenství. Princ Charles se však stále mohl stát skotským králem.
Třetí anglická občanská válka (1649-51)
Třetí anglická občanská válka byla ve skutečnosti spíše bojem mezi skotskou a anglickou armádou a z velké části se odehrávala ve Skotsku.
V roce 1649 zahájil markýz z Montrose ve Skotsku povstání na podporu krále Karla II. Karel se místo podpory Montrose rozhodl spojit se skotskými dohodáři. Ti se obávali, že Anglické společenství zabrání tomu, aby Skotsko mělo presbyteriánskou církev. V dubnu 1650 byl Montrose skotskými vojsky poražen. V červnu se Karel vylodil ve Skotsku a podepsal dohodu se skotskými Covenantory.
Cromwell odcestoval do Skotska a následující měsíc tam dorazil. Během následujícího roku ovládl hlavní části Skotska. Když Karel uprchl do Anglie, Cromwell ho následoval a nechal Jiřího Moncka, aby dokončil vítězství ve Skotsku. Když se tak stalo, Skotsko se stalo součástí Anglického společenství.
Karlova armáda táhla napříč Anglií do západních oblastí, kde měli roajalisté největší podporu. Nenašli však tolik příznivců, kolik by si přáli. Cromwell je našel a porazil je v bitvě u Worcesteru 3. září 1651. Karel uprchl do Nizozemska. Vrátil se až v roce 1660.
Irské povstání
Irské povstání, které začalo v roce 1641, pokračovalo až do roku 1652. Bojovali v něm hlavně irští katolíci proti vojskům anglických parlamentářů, skotských Covenantů a protestantských osadníků v Irsku. Zpočátku povstalci bojovali také proti anglickým roajalistickým armádám, ale to většinou ustalo po září 1843. Sedm měsíců po zahájení povstání vytvořili povstalci v Kilkenny vlastní vládu. Ta byla známá jako Irská katolická konfederace.
V roce 1649 se Oliver Cromwell vydal do Irska a potlačil jejich povstání. Cromwell zůstal v Irsku v paměti jako brutální útočník, zejména kvůli velkému počtu lidí zabitých při obléhání Droghedy. Některé boje v Irsku pokračovaly až do roku 1653.