30. června Nesmrtelná sedmička tajně požádala Viléma, který byl s Marií v Nizozemsku, aby přijel do Anglie s vojskem. Vilém, který žárlil na Mariino postavení a moc, zprvu nechtěl jet. Marie však Vilémovi řekla, že jí na politické moci nezáleží. Řekla, že "nechce být ničím jiným než jeho manželkou a že udělá vše, co bude v jejích silách, aby se stal doživotním králem".
William souhlasil s útokem. Prohlásil, že Jakubův novorozený syn je "předstíraný princ z Walesu". Předložil také seznam toho, co Angličané chtějí, a prohlásil, že si přeje pouze "svobodné a zákonné shromáždění parlamentu". Nizozemská armáda, kterou v říjnu odvrátila bouře, se vylodila 5. listopadu. Anglická armáda a námořnictvo přešly k Vilémovi. V této době byla důvěra Angličanů v Jakuba velmi nízká. Ani se nepokusili svého krále zachránit. Dne 11. prosince se král pokusil o útěk, ale nepodařilo se mu to. O další útěk se pokusil 23. prosince. Tento druhý pokus byl úspěšný a Jakub uprchl do Francie. Tam žil ve vyhnanství až do své smrti.
Ačkoli byla Marie kvůli sesazení svého otce smutná, William jí nařídil, aby se po příjezdu do Londýna tvářila šťastně. Lidé si proto mysleli, že se k otci chová chladně. Jakub si také myslel, že je mu jeho dcera nevěrná. To Marii hluboce ranilo.
V roce 1689 se sešel parlament Konventu svolaný princem Oranžským, aby projednal, co by měl udělat. Vilém Oranžský se cítil ve svém postavení nepohodlně. Chtěl vládnout jako král, ne pouze jako manžel královny. Jediný příklad společné monarchie pocházel ze šestnáctého století. Jednalo se o královnu Marii I. a španělského prince Filipa. Když se brali, bylo dohodnuto, že princ Filip přijme titul krále. Filip II. byl však králem pouze za života své manželky. Neměl také příliš velkou moc. Vilém chtěl zůstat králem i po smrti své manželky. Někteří významní lidé navrhovali, aby se jedinou panovnicí stala Marie. Marie, která byla svému manželovi věrná, to však odmítla.