Po útoku na Pearl Harbor 7. prosince 1941 bylo japonské námořnictvo a jeho letectvo poraženo v několika důležitých bitvách, například u Midway a ve Filipínském moři. Přišlo o mnoho lodí (včetně téměř všech japonských letadlových lodí), stovky stíhacíchletounů a mnoho svých nejlepších pilotů. Japonský průmysl byl ve srovnání s americkým malý a velmi chudý. Z tohoto důvodu Spojené státy velmi rychle nahradily své ztracené lodě a letadla lepšími; Japonsko jich však dokázalo vyrobit jen několik, a navíc nekvalitních. V letech 1943-44 se spojenecká vojska přesouvala k Japonsku. V bitvě ve Filipínském moři 19.-20. června 1944 byly japonské síly zatlačeny zpět na Filipíny.
15. července byl Saipan (Severní Mariany) dobyt spojeneckými silami. Dobytí Saipanu umožnilo armádnímu letectvu Spojených států zaútočit na samotné Japonsko pomocí bombardérů B-29 Superfortress. Po pádu Saipanu japonští velitelé věděli, že se Spojenci jako další pokusí dobýt Filipíny. Filipíny byly velmi důležité, protože se nacházely mezi ropnými poli jihovýchodní Asie a Japonskem. Pokud by Japonsko ztratilo kontrolu nad Filipínami, zbylo by mu jen málo paliva pro jeho lodě. Dne 17. října zahájili Spojenci útok na Filipíny v bitvě v zálivu Leyte.
Japonskému letectvu v Manile velel viceadmirál Takidžiro Oniši. Pochopil, že s tak malým počtem letadel a vycvičených pilotů nelze v bitvě zvítězit. Z tohoto důvodu se rozhodl vytvořit sebevražednou útočnou jednotku, Special Attack Unit. Na misi se dobrovolně přihlásila skupina 24 studentských pilotů. Zvláštní útočná jednotka byla organizována do 4 skupin: Jednotka Šikišima, Jednotka Jamato, Jednotka Asahi a Jednotka Jamazakura. Tyto názvy byly převzaty z vlastenecké básně (waka nebo tanka), kterou napsal japonský klasik Motoori Norinaga: (敷島の 大和心を 人問はば 朝日に匂う 山桜花). Báseň zní: "Shikishima no Yamato-gokoro wo hito towaba, asahi ni niou yamazakura bana.
|  | Pokud se někdo zeptá na ducha Jamato (ducha starého/pravého Japonska) Šikišimy (poetický název Japonska) - jsou to květy jamazakury (rozkvetlé horské třešně), které voní při východu slunce Asahi. (Méně doslovný překlad by mohl znít: Pokud se někdo ptá na ducha Japonska, jsou to květy horských třešní, které voní při vycházejícím slunci. ) |  |
Japonci byli v bitvě u zálivu Leyte poraženi, ale speciální útočné jednotky měly velký úspěch. První útok kamikadze se uskutečnil 21. října 1944 na vlajkovou loď Královského australského námořnictva HMAS Australia. Při útoku zahynulo 30 námořníků včetně jejího kapitána Emila Dechaineuxe a mnoho dalších bylo zraněno. Do 26. října bylo napadeno dalších 47 spojeneckých lodí. Většina z nich byla těžce poškozena nebo potopena, stejně jako americká letadlová loď USS St. Lo.
Tento první úspěch přesvědčil japonské velitele, aby v útocích kamikadze pokračovali. K činnosti kamikadze bylo naverbováno mnoho dalších pilotů. Během několika následujících měsíců podniklo takové útoky více než 2 000 letadel. Když začaly docházet japonské zásoby letadel, byly pro tyto mise postaveny nové modely nízké kvality. Některé z nich, jako například Nakajima Ki-115 Tsurugi, byly vyrobeny převážně ze dřeva a používaly zásoby starších motorů. Podvozek letadla pilot po vzletu obvykle odhodil, aby jej mohl použít jiný letoun, protože by už znovu nepřistál. Podobné programy sebevražedných útoků byly plánovány včetně raketových bomb s piloty (tzv. Ohka) a ponorkových torpéd (Kaiten).
Vrcholem útoků kamikadze byla operace Kikusui ("plovoucí chryzantémy") od 6. dubna do 25. května 1945 během bitvy o Okinawu. V té době proběhlo sedm významných vln útoků, kterých se zúčastnilo více než 1 500 letadel kamikadze. Protože jejich výcvik byl příliš krátký a jejich letadla byla špatně vyrobená, byli piloti kamikadze snadným cílem pro zkušené spojenecké piloty, kteří měli také mnohem lepší letadla. Přesto však kamikadze, kteří unikli protiletadlové palbě a nepřátelským stíhacím letounům, způsobili spojeneckému loďstvu velké škody. Spojenci bitvu vyhráli, ale kvůli útokům kamikadze ztratili mnoho lodí a mužů. Do konce bitvy bylo kamikadze potopeno nejméně 21 amerických lodí. Některé lodě ostatních spojeneckých námořních sil byly také potopeny a desítky dalších byly poškozeny.
Stovky dalších letounů kamikadze byly připraveny bránit Japonsko před invazí. Po kapitulaci Japonska 15. srpna po atomovém bombardování Hirošimy a Nagasaki a vyhlášení války Sovětským svazem však již nikdy nebyly použity.