Mnoho křesťanů, ale ne všichni, uctívá Boha v podobě Trojice. Ve Starém zákoně je několik míst, kde se zdá, že existuje důkaz o existenci Trojice. V Genesis 1,26 se píše, že Bůh řekl: "Učiňme člověka k našemu obrazu". Deuteronomium 6,4 uvádí, že "Hospodin, náš Bůh, je jeden Pán". Slovo, které bylo přeloženo jako jeden, lze také přeložit jako sjednocený.
Trojice je naznačena i v Novém zákoně, i když se tento termín nepoužívá. Ježíš ji ve svém učení lidem nikdy plně nevysvětlil, ale několikrát se prohlásil za Boha. Učedník Jan byl jedním z Ježíšových nejlepších přátel na Zemi, takže Ježíšovi rozuměl lépe než mnoho jiných lidí. Své evangelium začíná slovy: "Na počátku bylo Slovo. To Slovo bylo u Boha a to Slovo byl Bůh." Nazývá Ježíše "Slovem", protože Ježíš byl způsobem, jakým Bůh o sobě lidem vyprávěl. V Janově evangeliu 8,58 Ježíš říká: "Dříve než se Abraham narodil, JÁ JSEM!". JÁ JSEM je to, co Bůh řekl Mojžíšovi, že je jeho jméno, což znamená, že je vždy a všude v čase a prostoru. V Janově evangeliu 10,30 a 10,38 říká lidem: "Otec a já jsme jedno." a "Otec je ve mně a já jsem v Otci". A konečně odpustil lidem hříchy, což může udělat jen Bůh.
Když Ježíš přišel, museli první křesťané pochopit, že Bůh mezi ně přišel skrze moc Ducha svatého. Matouš ve svém evangeliu píše: Matouš 28:19). "Jděte tedy, získávejte za učedníky všechny národy a křtěte je ve jménu Otce i Syna i Ducha svatého. V Janově evangeliu se často objevuje několik věcí, které poukazují na Boha, který je víc než jen jedna bytost. O třech Božích osobách se zmiňuje také druhá kniha Korintským.
Trvalo několik set let po Ježíšově životě, než mnozí křesťané přijali myšlenku, že Bůh je Trojice. Byla to obtížná myšlenka, protože hebrejská písma hovoří o tom, že Bůh je jeden. Řekové a Římané mohli Krista chápat pouze jako osobu, která přináší Boží slovo. Teprve ve 4. století byli uznáni za tři části jednoho celého Boha. Rozhodl o tom Nicejský koncil v roce 325. Do konce století se mnoho křesťanů přiklonilo k víře v Boha jako Trojici.
V 5. století přinesl svatý Patrik do Irska křesťanství. Stará irská legenda říká, že Patrik použil šamot, aby vysvětlil myšlenku Trojice. Šípková růže má tři malé listy. Patrik lidem řekl, že tyto tři lístky představují Boha Otce, Boha Syna a Boha Ducha svatého. Řekl, že celá rostlina představuje Boha.
V křesťanských církvích se neděle po Letnicích (50. den po Velikonocích) nazývá "svátek Nejsvětější Trojice". Tento svátek vznikl pravděpodobně v 10. století. V roce 1334 jej papež Jan XXII. oficiálně vyhlásil pro celou církev. V anglikánské a luteránské církvi se týdny, které následují po svátku Nejsvětější Trojice, datují podle toho, kolik týdnů po Trojici následují (např. 20. neděle po Trojici). V římské liturgii jsou tyto neděle datovány "po Letnicích" (např. 21. neděle po Letnicích).