Sépiová kost
Sépie mají vnitřní sépiovou kost z uhličitanu vápenatého. Je pórovitá, plná malých otvorů, Vztlak sépiové kosti se může měnit, což sépii umožňuje klesat nebo stoupat výš změnou množství plynu a kapaliny v jejích komorách. Sépiová kost každého druhu má odlišný tvar, velikost a vzor hřebenů nebo strukturu. Sépie používají šperkaři a stříbrníci jako formy pro odlévání drobných předmětů. Dnes jsou pravděpodobně známější jako materiál, který se dává domácím ptákům jako zdroj vápníku. Sépiová kost se vyskytuje pouze u sépií a je jedním ze znaků, kterými se liší od chobotnic a jiných měkkýšů.
Změna barvy
Sépie jsou někdy nazývány mořskými chameleony, protože jsou schopny měnit barvu své kůže. Jejich kůže se může zbarvit do barevného vzoru, aby komunikovala s ostatními sépiemi a maskovala se před predátory. Tuto funkci změny barvy zajišťují skupiny červených, žlutých, hnědých a černých pigmentových chromatoforů nad vrstvou reflexních iridoforů a leukoforů. Všechny tyto látky se nacházejí v kůži sépie a společně mění její barvu. Na milimetr čtvereční připadá až 200 těchto speciálních pigmentových buněk.
Pigmentové chromatofory mají váček s pigmentem a velkou membránu, která je při zatažení složená. Po stranách je 6-20 malých svalových buněk, které se mohou stahovat a stlačovat elastický váček do kotouče proti kůži.
Iridofory jsou destičky z chitinu nebo bílkovin, které mohou odrážet světlo. Jsou zodpovědné za kovově modrou, zelenou, zlatou a stříbrnou barvu, které jsou často vidět u sépií. Všechny tyto buňky lze použít v kombinacích. Kromě toho, že sépie mohou ovlivňovat barvu světla, které se odráží od jejich kůže, mohou také ovlivňovat polarizaci světla, což lze využít k signalizaci jiným živočichům, kteří polarizaci vnímají.
Oči
Oči sépií patří k nejvyvinutějším v živočišné říši. Způsob vývoje očí hlavonožců se zásadně liší od očí obratlovců, jako je člověk, ale jejich fungování je dosti podobné. Podobnost očí hlavonožců a obratlovců je příkladem konvergentní evoluce. Přestože nevidí barvy, dokáží vnímat polarizaci světla, což zlepšuje jejich schopnost vidět kontrast. Na sítnici mají dvě místa soustředěných senzorových buněk (tzv. fovea), jedno pro pohled více dopředu a druhé pro pohled více dozadu. Čočky, místo aby se přetvářely jako u lidí, se naopak přetahují tak, že se přetváří celé oko, aby se změnilo zaostření.
Krev
Krev sépií má neobvyklý zelenomodrý odstín, protože k přenosu kyslíku používá bílkovinu hemocanin obsahující měď namísto červené bílkoviny hemoglobin obsahující železo, která se vyskytuje u obratlovců. To je podobné krvi členovců. Hemocyanin není tak dobrý v přenosu kyslíku jako hemoglobin. Krev je čerpána třemi samostatnými "srdci". Dvě z nich slouží k pumpování krve do páru žaber sépie (jedno srdce pro každou žábu) a třetí k pumpování krve po zbytku těla.