Zárodečná teorie nemocí je biologická teorie. Říká, že nemoci způsobují malé organismy (tzv. zárodky), známé také jako mikrobi. Většina nemocí, ale ne všechny, jsou infekční nemoci. Zárodečná teorie říká, že malé organismy způsobují v těle nakažených osob reakci. Reakce těla na infekci se nazývá nemoc.
Mnoho vědců a lékařů v historii přišlo na to, že nemoci způsobují mikroskopické organismy. Ani po vynálezu mikroskopu lidé stále nevěděli, že nemoci způsobují zárodky. Lidé dlouho věřili, že příčinou nemocí je "špatný vzduch" ze zapáchajících skládek odpadků a z hnijícího masa. Lidé si proto mysleli, že zakrytí úst a nosu látkou pomůže "špatný vzduch" odfiltrovat. Vědci a lékaři používali česnek a parfémy, aby špatný vzduch zahnali. Lidé však přesto onemocněli a dokonce umírali, takže tato teorie byla mylná. Znečištěný vzduch není příčinou nemocí.
Jedním z problémů starých teorií nemocí bylo, že lidé věřili, že živé organismy vznikají samovolně. Spontánní generace je, když z malého smítka masa vyroste něco jako moucha. Této staré teorii se říká abiogeneze. V sedmnáctém století Francesco Redi (18. února 1626 - 1. března 1697) objevil, že mouchy kladou vajíčka, ze kterých se stávají larvy. Předtím si lidé mysleli, že červi pocházejí z hnijícího masa. Zjistil to tak, že uzavřel maso do sklenice a pozoroval ho. Na zapečetěném mase žádné červy nenašel. Do sklenice také vložil trochu masa a přikryl ho gázou. Na gáze červy našel, ale uvnitř sklenice ne. Když však vložil maso do otevřené sklenice, našli se červi na mase i uvnitř sklenice. Podobné pokusy prokázaly, že červi pocházejí z much, které kladou vajíčka, a nikoli z hnijícího masa. Později vědci dokázali, že nemoci nepocházejí ze vzduchu. Nemoci se šíří infekcí.


