Bakteriální konjugace je přenos genetického materiálu mezi bakteriálními buňkami přímým kontaktem mezi buňkami nebo spojením mezi dvěma buňkami podobným mostu.
Konjugace je mechanismus horizontálního přenosu genů, stejně jako transformace a transdukce, ačkoli tyto dva další mechanismy nezahrnují kontakt mezi buňkami.
Bakteriální konjugaci objevili nositelé Nobelovy ceny Joshua Lederberg a Edward Tatum. Ukázali, že bakterie Escherichia coli vstoupila do sexuální fáze, během níž může sdílet genetickou informaci.
Bakteriální konjugace je často nesprávně považována za ekvivalent pohlavního rozmnožování, protože zahrnuje výměnu genetického materiálu. Při konjugaci poskytuje dárcovská buňka konjugativní nebo mobilizovatelný genetický prvek, kterým je nejčastěji plazmid nebo transpozon. Většina konjugativních plazmidů má systémy zajišťující, že přijímající buňka již neobsahuje podobný prvek.
Přenesená genetická informace je často pro příjemce přínosná. Mezi výhody může patřit odolnost vůči antibiotikům, tolerance vůči xenobiotikům nebo schopnost využívat nové metabolity. Takové prospěšné plazmidy lze považovat za bakteriální endosymbionty. Jiné prvky však lze považovat za bakteriální parazity a konjugaci za jimi vyvinutý mechanismus umožňující jejich šíření.

