Clostridium difficile je druh bakterie. Často se jí říká C. diff (vyslovuje se "viz diff"). Jedná se o grampozitivní bakterii, která patří do rodu Clostridium.

C. diff může žít v lidském tlustém střevě, aniž by způsoboval jakékoli problémy. C. diff žije v tlustém střevě asi u 2-5 % dospělých. U některých lidí však C. diff způsobuje závažná onemocnění. U těchto lidí se bakterie C. diff v tlustém střevě vymknou kontrole. Bakterie napadají sliznici střev. To způsobuje problém nazývaný kolitida způsobená C. diff. Kolitida je zánět (otok) tlustého střeva.

Infekce C. diff je stále častější v nemocnicích, pečovatelských domech a dalších zdravotnických zařízeních. Jen ve Spojených státech na ni ročně zemře přibližně 14 000 lidí.