Potravní zvyklosti quetzalcoatla (který měl dlouhý zobák bez zubů) nejsou známy. Tato otázka, stejně jako jeho let, je stále předmětem diskusí. Hlavním problémem při vyvozování závěrů je absence podrobnější kostry. Byly navrženy dvě teorie.
Podle jedné z myšlenek se živil rybami tak, že létal s čelistí ve vodě a když na ně narazil, ryby chňapl. Texas byl v té době z velké části pokryt západním vnitrozemským mořem. "Z těchto navrhovaných způsobů života se zřejmě nejvíce prosadila piscivorie [pojídání ryb] za letu, přičemž často navrhovaným způsobem získávání potravy je skim-feeding.
Podle jiné teorie se živil na souši, částečně jako mrchožrout, podobně jako supi a káňata, a sháněl potravu pro drobné živočichy. Tento názor získává na popularitě, protože čelist nevykazuje adaptace ke skimmingu, které se vyskytují u moderních ptáků, kteří tímto způsobem loví ryby.
Při letu byl jistě stoupavý, létal ve vzestupných proudech vzduchu v teplém prostředí a jeho pozůstatky pocházejí z lokality, která se v křídě nacházela daleko ve vnitrozemí.