Inkubační doba je doba, která uplyne ode dne, kdy se člověk nakazí patogenem (něčím, co způsobuje nemoc, např. virem), do dne, kdy se u něj začnou projevovat příznaky nemoci. Pokud je například člověk nakažen běžným nachlazením, trvá obvykle přibližně jeden až tři dny, než se u něj začnou projevovat příznaky nachlazení. To znamená, že inkubační doba běžného nachlazení je jeden až tři dny.
U některých nemocí, jako je virus lidské imunitní nedostatečnosti (HIV, virus způsobující AIDS), může člověk nakazit jiné lidi virem HIV i během inkubační doby. I když osoba s HIV nemá žádné příznaky, virus během inkubační doby vytváří své kopie.