Endokrinní systém zahrnuje ty tělesné orgány, které produkují hormony. Pomáhá regulovat metabolismus, růst a vývoj, funkci tkání a podílí se také na náladě. Oborem medicíny, který se zabývá poruchami žláz s vnitřní sekrecí, je endokrinologie.
Endokrinní systém je ve fyziologii soustava žláz, z nichž každá vylučuje určitý typ hormonu přímo do krevního řečiště a reguluje tak činnost organismu.
Endokrinní systém je na rozdíl od exokrinního systému, který vylučuje chemické látky pomocí kanálků. Endokrinní systém je podobně jako nervový systém systémem informačních signálů, jeho účinky a mechanismus jsou však odlišné.
Účinky endokrinního systému se projevují pomalu a jejich odezva je dlouhodobá. Nervový systém vysílá informace rychle a reakce jsou zpravidla krátkodobé. Hormony jsou složité chemické látky uvolňované z endokrinní tkáně do krevního oběhu, odkud putují do cílových tkání a vyvolávají reakci.
Endokrinní žlázy se obecně vyznačují tím, že nemají žádné kanálky, jsou dobře prokrvené a obvykle mají uvnitř buněk vakuoly nebo granule, v nichž se ukládají hormony.
