Hermann Emil Fischer (9. října 1852 - 15. července 1919) byl německý chemik, který v roce 1902 získal Nobelovu cenu za chemii.

Fischer byl zakladatelem chemie primárních přírodních produktů: sacharidů, purinů a nukleosidů, peptidů a proteinů. Mezi jeho četné objevy patřila struktura sacharidů a jako první získal syntetické peptidy. Studoval účinné látky čaje, kávy a kakaa, konkrétně kofein a teobromin.

Fischer také navrhl model "lock & key" působení enzymů.