Umlčování genů je obecný termín popisující epigenetické procesy regulace genů. Používá se k popisu "vypnutí" genu jiným mechanismem, než je genetické inženýrství. To znamená, že gen, který by byl za normálních okolností exprimován ("zapnut"), je vypnut pomocí mechanismů v buňce. Když je gen umlčen, znamená to, že jeho RNA není schopna vytvářet protein.
Geny jsou regulovány buď ve fázi transkripce, nebo později, před translací.
Transkripční umlčování genů probíhá pomocí modifikací histonů, které kolem genu vytvářejí heterochromatin. To znamená, že transkripční stroje (RNA polymeráza, transkripční faktory atd.) se ke genu nedostanou. Geny mohou být umlčeny metylací DNA. K tomu dochází pravidelně během vývoje, kdy se geny v různých fázích zapínají a vypínají.
Posttranskripční umlčování genů se provádí zablokováním nebo zničením mRNA určitého genu. Zničení mRNA zabrání translaci a vytvoření aktivního genového produktu (ve většině případů proteinu). Běžným způsobem umlčování mRNA je RNAi.
K regulaci genů se používá jak transkripční, tak posttranskripční umlčování genů. Metody umlčování genů také chrání genom organismu před transpozony a viry. Umlčování genů tak může být součástí prastarého imunitního systému chránícího buňky před takovou infekční DNA a RNA.