Kalifornie se v americké občanské válce podílela na posílání zlata na východ, na náboru dobrovolníků, kteří měli nahradit pravidelné armádní jednotky na západě Spojených států, a na údržbě a výstavbě četných táborů a opevnění. Stát Kalifornie neposílal své jednotky na východ, ale mnoho občanů cestovalo na východ a vstoupilo do armády Unie. Kalifornští dobrovolníci také vedli mnoho operací proti indiánskému obyvatelstvu na území státu a v dalších západních teritoriích Pacifického departementu a Nového Mexika.

Po zlaté horečce osídlili Kalifornii především farmáři, horníci a podnikatelé ze Středozápadu a Jihu. Stát od jeho založení ovládali demokraté. Jižanští demokraté sympatizovali s Konfederací amerických států, která se odtrhla, ale ve státě tvořili menšinu. Významnou roli v kalifornské politice hráli kalifornští podnikatelé, kteří ovládali doly, lodní dopravu, finance a Republikánskou stranu. Až do secesní krize však byli menšinovou stranou.