V roce 793 vyděsil vikingský nájezd na Lindisfarne mnoho lidí na celém křesťanském Západě. Rok 793 je často označován za počátek věku vikingských nájezdů. Velmi známá pasáž v anglosaské kronice zní:
"V tomto roce se nad zemí Northumbrie snesla krutá, předvídavá znamení. Vyskytovaly se nadměrné vichřice, bouře s blesky a na obloze byli vidět létat ohniví draci. Po těchto znameních následoval velký hladomor a 8. ledna téhož roku pustošení pohanů zničilo Boží kostel v Lindesfarne."
Nakonec mniši z ostrova uprchli. Vzali s sebou tělo svatého Cuthberta, které je nyní pohřbeno v durhamské katedrále. Převorství bylo obnoveno v normanské době jako benediktinský dům a fungovalo až do svého zrušení v roce 1536 za Jindřicha VIII. Nyní je z něj zřícenina v péči organizace English Heritage, která poblíž provozuje také muzeum/návštěvnické centrum. Sousední farní kostel (viz níže) je stále v provozu.
V Lindisfarne se nachází také malý hrad založený na tudorovské pevnosti, který je přístupný návštěvníkům.
Na ostrově Holy Island malovali J. M. W. Turner, Thomas Girtin a Charles Rennie Mackintosh.