Protilátky (nazývané také imunoglobuliny) jsou velké bílkoviny ve tvaru písmene Y, které mohou ulpívat na povrchu bakterií a virů. Nacházejí se v krvi nebo jiných tělních tekutinách obratlovců. Protilátky jsou klíčovým prvkem adaptivního imunitního systému.
Protilátka rozpoznává jedinečnou část cizího cíle, která se nazývá antigen. Každý hrot "Y" protilátky obsahuje strukturu (jako zámek), která se hodí k jedné konkrétní struktuře podobné klíči na antigenu. Tím se obě struktury spojí dohromady.
Pomocí tohoto vazebného mechanismu může protilátka označit mikroba nebo infikovanou buňku, aby na ni mohly zaútočit další části imunitního systému, nebo může přímo neutralizovat svůj cíl. Produkce protilátek je hlavní funkcí humorální imunity.
Každá protilátka je jiná. Všechny jsou navrženy tak, aby napadaly pouze jeden druh antigenu (v praxi to znamená virus nebo bakterii). Například protilátka určená k ničení pravých neštovic není schopna zasáhnout dýmějový mor nebo běžnou rýmu.
Ačkoli je obecná struktura všech protilátek velmi podobná, malá oblast na konci proteinu je velmi variabilní. Díky tomu existují miliony protilátek s různou strukturou hrotu. Každá z těchto variant se může vázat na jiný antigen. Tato obrovská rozmanitost protilátek umožňuje imunitnímu systému rozpoznat stejně širokou škálu antigenů.


