Šupinatí

Chobotnatci jsou monofyletickou skupinou, která je sesterskou skupinou tuatar. Squamates a tuatara jsou společně sesterskou skupinou krokodýlů a ptáků, žijících archosaurů.

Fosilie chobotnatců se poprvé objevují na počátku jury, ale mitochondriální fylogeneze naznačuje, že se vyvinuli na konci permu. Evoluční vztahy v rámci chobotnatců nejsou dosud zcela propracovány, přičemž nejproblematičtější je vztah hadů k ostatním skupinám.

Na základě morfologických údajů se předpokládalo, že se leguánovití ještěři oddělili od ostatních chobotnatců velmi brzy, ale nedávné molekulární fylogeneze, jak z mitochondriální, tak jaderné DNA, tuto brzkou divergenci nepotvrzují. Vzhledem k tomu, že hadi mají rychlejší molekulární hodiny než ostatní chobotnatci a existuje jen málo fosilií raných předků hadů a chobotnatců, je obtížné vyřešit vztah mezi hady a ostatními skupinami chobotnatců.

Nejnovější výzkumy naznačují, že evoluční původ jedu leží hluboko ve fylogenezi chobotnatců. 60 % chobotnatců tvoří jedovaté druhy rodu Toxicofera.

Jed u čeledí Caenophidia, Anguimorpha a Iguania se vyvinul jednou, pak se tyto tři čeledi rozdělily. Všechny tři linie mají devět společných toxinů. Fosilní záznamy ukazují, že divergence mezi anguimorfami, leguány a pokročilými hady se datuje zhruba 200 MYA do období svrchního triasu a spodní jury.

Hadí jed se vyvinul duplikací genu kódujícího normální regulační nebo bioaktivní protein. Tato kopie byla následně exprimována v jedové žláze.

Různé toxiny byly rekrutovány z různých proteinů a jsou různorodé jako samotné funkce.

Přírodní výběr vedl k diverzifikaci toxinů, aby se zabránilo obraně kořisti. Jedové geny tvoří velké multigenové rodiny a vyvíjejí se evolucí proteinů. To vede k diverzifikaci toxinů, které umožňují sedícím predátorům napadat širokou škálu kořisti.

Rychlá evoluce a diverzifikace je výsledkem evolučních závodů ve zbrojení mezi kořistí a predátorem, kdy se jeden přizpůsobuje druhému.

Klasicky se řád dělí na tři podřády:

• Lacertilia, ještěrky;
• Serpentes, hadi;
• Amphisbaenia, červí ještěrky.

Ještěrky z nich tvoří parafyletickou skupinu. V novějších klasifikacích se pro plazy a ptáky obecně používá název Sauria a Squamata se dělí odlišně:

• Podřád Iguania (leguáni a chameleoni)
• Podřád Scleroglossa
• Infrařád Gekkota (gekoni)
• infrařád Anguimorpha (monitory, gila monster a pomalí červi)
• infrařád Scincomorpha (scinkové, ještěrky bičíkovité a ještěrky obecné)
• Podřád Serpentes (hadi)
• Podřád Alethinophidia (zmije, hroznýši, kobry atd.)
• infrařád Scolecophidia (slepí hadi)
• Podřád Amphisbaenia