V 17. století žili Dakotové ve Wisconsinu a Minnesotě. Do roku 1700 se část z nich přestěhovala do dnešní Jižní Dakoty. Koncem 17. století se Dakotové spojili s francouzskými obchodníky. Francouzi se snažili využít tohoto spojenectví, aby jim pomohlo ovládnout severoamerický obchod s kožešinami proti Angličanům.
Válka v Dakotě v roce 1862
Na konci 50. let 19. století vedlo porušování smluv ze strany Spojených států a nespravedlivé platby ze strany indiánských agentů (vládních osob, které měly povoleno komunikovat s domorodci) k rostoucímu hladu a strádání Dakotů. I když se Dakotové snažili s vládou USA vyjednávat, nic se nedařilo. Dne 16. srpna 1862 skupina dakotských lovců zabila rodinu osadníků. To vedlo k dalším útokům na osadníky a brzy začala plnohodnotná válka. Dne 5. listopadu 1862 bylo 38 dakotských bojovníků odsouzeno k trestu smrti oběšením. Tato poprava se později stala největší hromadnou popravou v dějinách USA.
Během povstání a po něm mnoho Východních Dakotů a jejich rodin opustilo Minnesotu a Východní Dakotu a odešlo do Kanady nebo se usadilo v údolí řeky James v krátkodobé rezervaci. Poté byli nuceni přestěhovat se do rezervace Crow Creek na východním břehu řeky Missouri. Někteří se připojili k Západním Dakotům a přesunuli se dále na západ, aby pomohli lakotským kmenům pokračovat v boji proti americké armádě.
Ostatní zůstali v Minnesotě a na východě, v malých rezervacích, které stále existují, včetně rezervací Sisseton-Wahpeton, Flandreau a Devils Lake (Spirit Lake nebo Fort Totten) v Dakotě. Někteří se přestěhovali do Nebrasky, kde má dnes kmen Santee Siouxů rezervaci na jižním břehu řeky Missouri.
Ti, kteří uprchli do Kanady, zanechali pro své rodiny devět malých rezervací v Manitobě (Sioux Valley, Long Plain, Dakota Tipi, Birdtail Creek a Oak Lake [Pipestone]) a další čtyři (Standing Buffalo, Moose Woods [White Cap], Round Plain [Wahpeton] a Wood Mountain) v Saskatchewanu.