Candidatus
Kandidát je termín v taxonomii (vědecké klasifikaci) bakterií.
Je to označení, které se dává před název bakterie, kterou nelze kultivovat na agarové plotně ani v žádné jiné bakteriologické kultuře. Příkladem může být "Candidatus Phytoplasma allocasuarinae". Status Candidatus lze použít v případě, že je druh nebo rod dobře prozkoumán, ale nelze jej kultivovat. V současné době se mnoho informací získává analýzou sekvence 16S ribozomální RNA.
Historie
Pro správné zveřejnění druhu musí být bakterie izolovány, kultivovány, popsány a uloženy v bakteriologické kultivační sbírce. Některé bakterie však vyžadují speciální podmínky tkáňových kultur a nelze je udržovat ve sbírkách bakteriologických kultur. Patří sem bakterie, které žijí uvnitř jiných organismů nebo buněk. Patří mezi ně obligátně intracelulární patogeny a endosymbionti, hmyzí symbionti a populace z oceánů nebo kalů.
V roce 1994 publikovali Murray a Schleifer taxonomickou poznámku. Doporučili, aby byla zavedena nová kategorie neurčitého stupně (Candidatus) pro některé předpokládané taxony, které nemohly být popsány dostatečně podrobně, aby bylo možné založit nový taxon. Rovněž bylo doporučeno, aby byl v časopise International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology vytvořen seznam Candidatus.
Podle "IRPCM Phytoplasma/Spiroplasma Working Team - Phytoplasma taxonomy group" by zkratka pro Candidatus měla být Ca.
Otázky a odpovědi
Otázka: Co je to Candidatus?
A: Candidatus je termín používaný v taxonomii bakterií, který označuje označení, které se dává před název bakterie, kterou nelze vypěstovat v žádné jiné bakteriologické kultuře.
Q: K čemu slouží použití Candidatus?
Odpověď: Status Candidatus se používá v případě, kdy je druh nebo rod dobře prozkoumán, ale nelze jej kultivovat.
Otázka: Lze uvést příklad Candidatus?
Odpověď: Ano, příkladem Candidatus je "Candidatus Phytoplasma allocasuarinae".
Otázka: Proč nelze některé bakterie kultivovat?
Odpověď: Některé bakterie nelze kultivovat, protože nemohou růst na agarové plotně ani v žádné jiné bakteriologické kultuře.
Otázka: Jak se v dnešní době získává mnoho informací o bakteriích?
Odpověď: Mnoho informací o bakteriích se získává analýzou sekvence 16S ribozomální RNA.
Otázka: Používá se Candidatus pro bakterie, které nejsou dobře prozkoumány?
Odpověď: Ne, Candidatus se používá pro bakterie, které byly dobře prozkoumány, ale nelze je kultivovat.
Otázka: Je Candidatus určen výhradně pro bakterie?
Odpověď: Ano, Candidatus je termín používaný výhradně v taxonomii bakterií.
