Syntetická genomika
Syntetická genomika je druh genetického inženýrství. Vytváří geny, které se v přírodě nikdy nevyskytují.
Syntetická genomika nevyužívá přirozeně se vyskytující geny. Může využívat vlastní série bázových párů. V budoucnu by mohla používat genetické kódy, které se neskládají ze dvou párů bází DNA, jež v současnosti používají formy života.
Syntetická genomika využívá techniky z genetického výzkumu. Výzkumníci mohou levně a přesně vytvářet dlouhé řetězce párů bází ve velkém měřítku. To jim umožňuje provádět experimenty na genomech, které v přírodě neexistují. Využívají také myšlenky v oblasti skládání proteinů a špičková výpočetní zařízení.
Na tomto poli pracuje Institut J. Craiga Ventera. Tým asi dvaceti výzkumníků vedou nositel Nobelovy ceny Hamilton Smith, výzkumník DNA Craig Venter a mikrobiolog Clyde A. Hutchison III. Venterova skupina sestavila polosyntetický genom bakterie Mycoplasma genitalium rekombinací 25 překrývajících se fragmentů. To se podařilo v jediném kroku:
"Použití kvasinkové rekombinace výrazně zjednodušuje sestavování velkých molekul DNA ze syntetických i přírodních fragmentů."
Genetici vytvořili první syntetický chromozom pro kvasinky. "Geny v původním chromozomu byly nahrazeny syntetickými verzemi a hotový umělý chromozom byl poté úspěšně integrován do kvasinkové buňky."
Další společnosti, včetně společnosti s názvem Synthetic Genomics (společnost), byly založeny s cílem využít mnoho komerčních využití genomů navržených na míru.
Otázky a odpovědi
Otázka: Co je to syntetická genomika?
Odpověď: Syntetická genomika je druh genového inženýrství, který vytváří geny, které se v přírodě nevyskytují. Nevyužívá přirozeně se vyskytující geny, ale místo toho může používat vlastní navržené řady párů bází.
Otázka: Jak syntetická genomika funguje?
Odpověď: Syntetická genomika využívá techniky z genetického výzkumu k levnému a přesnému vytváření dlouhých řetězců základních párů ve velkém měřítku. To umožňuje výzkumníkům experimentovat s genomy, které v přírodě neexistují. Využívají se také myšlenky ze skládání proteinů a špičková výpočetní zařízení.
Otázka: Kdo vede výzkum v této oblasti?
Odpověď: Tým J. Craig Venter Institute, který tvoří asi 20 výzkumníků, vedou nositel Nobelovy ceny Hamilton Smith, výzkumník DNA Craig Venter a mikrobiolog Clyde A. Hutchison III.
Otázka: Čeho již Venterova skupina dosáhla?
Odpověď: Venterova skupina sestavila polosyntetický genom bakterie Mycoplasma genitalium rekombinací 25 překrývajících se fragmentů v jediném kroku pomocí technologie rekombinace kvasinek. Kromě toho genetici vytvořili první syntetický chromozom pro kvasinky tím, že nahradili geny v původním chromozomu syntetickými verzemi a úspěšně jej integrovali do kvasinkové buňky.
Otázka: Existují nějaké komerční aplikace pro vlastní navržené genomy?
Odpověď: Ano, byly založeny společnosti, jako je Synthetic Genomics, aby využily mnoho komerčních využití genomů navržených na míru.
Otázka: Jaké experimenty lze se syntetickou genomikou provádět?
Odpověď: Experimenty lze provádět na genomech, které v přírodě neexistují, pomocí technik syntetické genomiky, jako je levné a přesné vytváření dlouhých řetězců párů bází ve velkém měřítku nebo rekombinace 25 překrývajících se fragmentů do jednoho kroku pomocí technologie rekombinace kvasinek.