Pseudosuchiáni se objevili na konci spodního triasu. Koncem středního triasu se stali dominantními suchozemskými masožravci. Jejich velkým obdobím byl svrchní trias, během něhož do jejich řad patřila řada skupin masožravců a jedna skupina býložravců.
Vymírání na konci triasu způsobilo vyhynutí většiny pseudosuchiánů. Předkové dnešních krokodýlů přežili. Studie publikovaná v roce 2010 naznačuje, že sopečné erupce změnily klima a způsobily masové vymírání, které vyhubilo hlavní konkurenty dinosaurů. Navíc to umožnilo dinosaurům vystřídat je na pozici dominantních suchozemských masožravců a býložravců.
S postupem druhohor se vyvinuly typičtější formy krokodýlů. Dinosauři byli dominantními živočichy na souši, ale proto-krokodýlům se dařilo v řekách, bažinách a oceánech. Tito raní krokodýli byli mnohem rozmanitější než dnes. S vymíráním na konci křídy vyhynuli dinosauři, s výjimkou ptáků, zatímco krokodýli pokračovali s malými změnami. Dnes jsou krokodýli, aligátoři a gharialové přežívajícími zástupci této linie.