Apatit je skupina fosfátových minerálů s vysokou koncentrací OH-, F-, Cl- nebo iontů v krystalu.
Apatit je charakteristický pro biologické systémy. Je to jeden z mála minerálů, které biologické mikroprostředí produkuje a využívá. Jeho tvrdost určuje 5 stupňů Mohsovy stupnice. Hydroxyapatit je hlavní složkou zubní skloviny a kostního minerálu.
Velká část kostního materiálu je v poměrně vzácné formě apatitu. V této formě chybí většina OH skupin a je zde mnoho karbonátových a kyselých fosfátových substitucí.
Fluorapatit (nebo fluoroapatit) je odolnější vůči působení kyselin než hydroxyapatit. V polovině 20. století bylo zjištěno, že v obcích, jejichž vodovod přirozeně obsahuje fluor, je nižší výskyt zubního kazu. Fluorovaná voda umožňuje v zubech výměnu fluoridových iontů za hydroxylové skupiny v apatitu. Stejně tak zubní pasty často obsahují zdroj fluoridových aniontů (např. fluorid sodný, monofluorfosforečnan sodný).