Aligátoři pocházejí pouze ze Spojených států a Číny.
Aligátoři američtí
Aligátoři američtí žijí převážně na jihovýchodě Spojených států. Podle Scholastické knihy rekordů z roku 2012 žije největší populace aligátorů v Louisianě, kde jich žijí asi dva miliony. Nejvíce aligátorů amerických žije v Louisianě nebo na Floridě, kde žije asi 1,3 milionu aligátorů. Jižní Florida je jediným místem, kde vedle sebe žijí aligátoři i krokodýli.
Aligátoři američtí nemohou žít ve slané vodě příliš dlouho, protože nemají solné žlázy. Proto žijí ve sladkovodním prostředí, jako jsou rybníky, bažiny, mokřady, řeky, jezera a močály, a také v brakickém prostředí.
Kdysi byl aligátor americký ohrožen. V 70. letech 20. století vláda Spojených států aligátory chránila na základě zákona o ohrožených druzích. Tento druh se výrazně zotavil a nyní se mu daří v mnoha divokých oblastech. Aligátor je státním plazem Floridy a je symbolem státu.
Čínští aligátoři
Aligátor čínský se v současnosti vyskytuje pouze ve východní Číně, v malé oblasti v povodí řeky Jang-c'-ťiang (podél pobřeží Atlantského oceánu).
Aligátor čínský je extrémně ohrožený. Vědci se domnívají, že ve volné přírodě žije už jen několik desítek aligátorů čínských. Ve skutečnosti žije mnohem více aligátorů čínských v zoologických zahradách po celém světě než ve volné přírodě. Rockefellerova přírodní rezervace v jižní Louisianě jich chová několik v zajetí ve snaze zachovat tento druh. V Miami MetroZoo na Floridě je také chovný pár aligátorů čínských.