Matthew Stanley Meselson (narozen 24. května 1930) je genetik a molekulární biolog působící na Harvardově univerzitě. Je známý tím, že spolu s Franklinem Stahlem prokázal semikonzervativní replikaci DNA.
Po získání doktorátu pod vedením Linuse Paulinga na Kalifornském technologickém institutu se Meselson stal v roce 1960 profesorem na Harvardově univerzitě. Tam působí dodnes jako profesor přírodních věd Thomas Dudley Cabot.
Ve slavném Meselson-Stahlově experimentu v roce 1958 spolu s Frankem Stahlem prokázali pomocí značení izotopů dusíku, že DNA se replikuje semikonzervativně. Kromě toho Meselson, François Jacob a Sydney Brenner v roce 1961 objevili existenci messengerové RNA. Meselson zkoumal opravy DNA v buňkách a způsob, jakým buňky rozpoznávají a ničí cizí DNA, a spolu s Wernerem Arberem se zasloužil o objev restrikčních enzymů.
Od roku 1963 se zajímá o chemickou a biologickou obranu a kontrolu zbrojení. Meselson spolupracoval s Henrym Kissingerem za Nixonovy vlády, aby přesvědčil prezidenta Richarda Nixona, aby se zřekl biologických zbraní, pozastavil výrobu chemických zbraní a podpořil mezinárodní smlouvu o zákazu biologických látek pro nepřátelské účely. V roce 1972 se z ní stala Úmluva o zákazu biologických zbraní.
Meselson získal řadu ocenění. Jeho laboratoř na Harvardu zkoumá biologickou a evoluční podstatu pohlavního rozmnožování, genetické rekombinace a stárnutí. Mnozí z jeho bývalých studentů jsou významní biologové, včetně nositele Nobelovy ceny Sidneyho Altmana, Marka Ptashneho, Susan Lindquistové, Stephena F. Heinemanna a Richarda I. Morimota.