Joseph Kony (výslovnost IPA: [koɲ]; narozen 1961) je ugandský vůdce partyzánské skupiny. Je vůdcem Armády božího odporu (LRA). Zatímco měl velkou podporu veřejnosti, LRA se obrátila proti svým příznivcům. Tvrdí, že tak učinili proto, aby "očistili" lid Acholi a proměnili Ugandu v teokracii řízenou Desaterem.
LRA je známá tím, že dělá civilistům velmi špatné věci. Dvě z těchto věcí jsou vraždy a znásilňování.
LRA se stala známou tím, co páchá na obyvatelích několika zemí. Mezi tyto země patří severní Uganda, Demokratická republika Kongo, Středoafrická republika, Jižní Súdán a Súdán. Ukradla a donutila bojovat za ni přibližně 66 000 dětí.
V roce 2005 byl Kony obviněn Mezinárodním trestním soudem v nizozemském Haagu z válečných zločinů. Dosud nebyl dopaden.