Létající lišky v Austrálii přenášejí dvě infekce, které mohou představovat vážné riziko pro lidské zdraví - australský netopýří lyssavirus a hendra virus (Henipavirus). Tyto nemoci přenášené netopýry, které se vyskytují pouze v Queenslandu, patří mezi nejsmrtelnější viry v západním světě. Přestože jsou tato onemocnění vzácná, zůstávají pro lékaře záhadou. Tyto nemoci přenášené netopýry jsou téměř vždy smrtelné. Lidské infekce těmito viry jsou naštěstí velmi vzácné.
Hendra virus je virus, který infikuje především megabaty (velké kaloňovití netopýři nebo "létající lišky") a který se může přenést na koně. Stejně jako ebola a marburg je hendra hemoragická horečka s vysokou až velmi vysokou úmrtností (50-90 %). Virus eboly i virus marburgu jsou spojovány s megabaty jako přenašeči infekce. Předpokládá se, že koně se nakazí virem hendry požitím potravy nebo vody kontaminované tělními tekutinami a výměšky infikovaných megabatů. Virus může být smrtelný jak pro lidi, tak pro koně. Pokud nedochází k manipulaci s létajícími liškami nebo k jejich přímému fyzickému kontaktu, je riziko pro veřejné zdraví zanedbatelné.
Je známo, že virus Hendra přenášený netopýry přežili pouze tři lidé. Doposud více než polovina lidí, kteří se nakazili virem Hendra, zemřela do šesti týdnů, avšak druhou queenslandskou nemoc přenášenou netopýry nepřežil nikdo. V roce 1994 byl lyssavirus - blízký příbuzný viru vztekliny - poprvé objeven u létající lišky s příznaky poblíž města Ballina v Novém Jižním Walesu (které leží na hranici s Queenslandem). Lyssavirus usmrtil jediné tři osoby, které se jím kdy nakazily.