Archamoeby jsou významnou skupinou améb. Mezi protisty jsou neobvyklé, protože nemají mitochondrie.
Do této skupiny patří mnoho rodů, které jsou vnitřními parazity nebo komenzály živočichů: například Entamoeba a Endolimax. Některé z nich jsou lidskými patogeny a způsobují nemoci, jako je amébová úplavice. Jiné rody archamoeb žijí ve sladkých vodách a mají bičíky. Většina z nich má jedno jádro a jeden bičík, ale obří améba Pelomyxa jich má mnoho.
Analýza 100 genů ukazuje, že archamoeby jsou součástí Amoebozoa, které ztratily své mitochondrie. Jsou blízce příbuzné slizovitým plísním. Parazitické a komenzální formy jako Entamoeba a Endolimax se vyvinuly odděleně od volně žijících předků.