Autofagie (což znamená "požírání sebe sama") je jedním ze základních buněčných mechanismů. Umožňuje řízené odbourávání nefunkčních nebo nepotřebných částí buňky. Tyto části buňky pak mohou být podle potřeby recyklovány.
K tomu dochází několika způsoby. Cílové části buňky mohou být izolovány od zbytku buňky v autofagozomu (vezikule s dvojitou membránou). Autofagozom se spojí s lyzozomy a jeho obsah se rozloží a recykluje. V extrémním případě hladovění podporuje rozklad buněčných složek přežití buňky tím, že udržuje její energetickou hladinu.
Název "autofagie" vymyslel belgický biochemik Christian de Duve v roce 1963. Identifikace genů souvisejících s autofagií u kvasinek v 90. letech 20. století umožnila vědcům zjistit mechanismy autofagie. To vedlo k udělení Nobelovy ceny za fyziologii nebo medicínu v roce 2016 japonskému výzkumníkovi Jošinori Ósumimu.
