Redaktor konkurenčního deníku New York Sun zaútočil na Pulitzera v tisku. Nazval ho "Židem, který se vzdal svého náboženství". To bylo v roce 1890. Tím chtěl odradit Pulitzerovy židovské čtenáře. Pulitzerův již tak chatrný zdravotní stav se rychle zhoršoval a on opustil redakci. Nadále aktivně řídil noviny ze svého prázdninového útočiště v Bar Harboru ve státě Maine a ze svého newyorského sídla.
V roce 1895 koupil William Randolph Hearst konkurenční New York Journal, což vedlo k válce o náklad. Tato konkurence s Hearstem, zejména zpravodajství před a během španělsko-americké války, spojila Pulitzerovo jméno se žlutou žurnalistikou.
Poté, co World v roce 1909 odhalil podvodnou platbu 40 milionů dolarů ze strany Spojených států francouzské společnosti Panamského průplavu, byl Pulitzer obviněn z pomluvy Theodora Roosevelta a J. P. Morgana. Soudy obvinění zamítly, což bylo vítězstvím svobody tisku.