Hermafrodit je termín pocházející od Hermafrodita, syna Herma a Afrodity. Používá se jako vědecký termín v biologii.
V zoologii se živočich, který může produkovat spermie i vajíčka, nazývá hermafrodit. Jako příklad lze uvést většinu žížal, které jsou hermafrodity. Současný hermafrodit má po celý život obě sady pohlavních orgánů. Sekvenční hermafrodit má nejprve vaječníky, které později nahradí varlata, nebo naopak.
V botanice se termín hermafrodit používá pro "kompletní" květy se samčími i samičími částmi a pro rostliny, které mají oboupohlavní rozmnožovací jednotky. Podrobnosti naleznete v části Pohlavnost kvetoucích rostlin.
U lidí není termín hermafrodit správný, protože skuteční funkční hermafroditi u lidí nejsou možní. Někdy dochází k chybám ve vývoji, které vedou ke vzniku intersexuálních osob. Definice intersexuálního pohlaví je :
"... jedinci bisexuálního druhu, kteří mají vlastnosti na pomezí samce a samice".
Intersexuálové mohou mít velmi malý penis a žádná varlata nebo velmi malou a krátkou vagínu a velký klitoris, který vypadá jako penis.