Clay Mathematics Institute (CMI) je soukromá nezisková nadace se sídlem v Cambridge ve státě Massachusetts. Institut se zabývá rozšiřováním a šířením matematických znalostí. Uděluje různá ocenění a sponzorské příspěvky nadějným matematikům. Bostonský podnikatel Landon T. Clay a jeho manželka Lavinia D. Clay ji založili v roce 1998. Prvním prezidentem CMI byl matematik z Harvardovy univerzity Arthur Jaffe.
Institut je známý především díky své Ceně tisíciletí, seznamu sedmi nejdůležitějších nevyřešených matematických otázek. Z nich byla od té doby vyřešena pouze Poincarého domněnka. Clayův institut se zabývá i dalšími činnostmi, včetně postdoktorského programu (každoročně je podporováno deset Clayových výzkumných stipendistů) a každoroční letní školy, jejíž sborníky jsou vydávány společně s Americkou matematickou společností.