Stejně jako většina malých dinosaurů byl Hypsilophodon dvounohý a pohyboval se po dvou nohách. Celé jeho tělo bylo stavěné pro běh; lehké, nízké, aerodynamické držení těla, dlouhé nohy a tuhý ocas pro udržení rovnováhy. To vše mu umožňovalo pohybovat se na svou velikost pozoruhodně rychle.
Hypsilophodon se živil nízko rostoucí vegetací a pravděpodobně dával přednost mladým výhonkům a kořenům na způsob dnešních jelenů. Stavba jeho lebky se zuby zasazenými daleko dozadu do čelisti jasně naznačuje, že měl líce, což je pokročilá vlastnost, která by usnadnila žvýkání potravy. V čelisti zvířete se nacházelo dvacet osm až třicet hřebenovitých zubů, které se díky svému střídavému uspořádání zřejmě samy brousily. Stejně jako u téměř všech dinosaurů a jistě i u všech ornitoskoků se zuby průběžně vyměňovaly.
Úroveň rodičovské péče u tohoto dinosaura nebyla stanovena, ačkoli bylo nalezeno úhledně uspořádané hnízdo, což naznačuje, že před vylíhnutím byla věnována určitá péče. Byly nalezeny fosilie velkých skupin, takže je pravděpodobné, že se zvířata pohybovala ve stádech. Z těchto důvodů jsou hypsilofodonti, zejména Hypsilophodon, často označováni jako "jeleni druhohor".
Přestože žil v křídě, měl Hypsilophodon řadu primitivních nebo bazálních znaků. Například na každé "ruce" měl pět prstů a na každé noze čtyři. Většina dinosaurů měla v období křídy méně prstů. Také, ačkoli měl zobák, měl Hypsilophodon ještě špičaté trojúhelníkové zuby v přední části čelisti. Většina býložravých dinosaurů v této fázi již přední zuby zcela ztratila (i když se vedou diskuse o tom, zda tyto zuby mohly mít u Hypsilophodona specializovanou funkci).
Skupina Hypsilophodontidae zůstala stejná od svrchní jury až do konce křídy. Je možné, že tomu tak bylo proto, že zvířata byla téměř dokonale přizpůsobena svému způsobu života, a proto byl selekční tlak, jak se předpokládá, nízký.