Golgiho komplex, známý také jako Golgiho aparát nebo jednoduše Golgiho aparát, je cytoplazmatická organela. Nachází se v buňkách eukaryot, jako jsou živočichové, rostliny a houby.

Komplex objevil Camillo Golgi v roce 1898. Golgi, který působil v italské Pavii, byl ignorován. O jeho objevu se říkalo, že je to špína na jeho čočkách. Po letech se na snímcích z elektronového mikroskopu objevily struktury stejné jako na původních Golgiho kresbách. Tvoří je několik zploštělých vakovitých membrán, které vypadají jako hromádka palačinek.

Hlavní funkcí Golgiho aparátu je zpracování a balení makromolekul, jako jsou proteiny a lipidy. Ty přicházejí do Golgiho aparátu poté, co byly vytvořeny, a předtím, než se dostanou na místo určení. Obecně lze říci, že to, co Golgi dělá, je Velká část enzymatického zpracování je posttranslační modifikace proteinů. Komplex Golgiho je kontroluje, zda nemají vady, a zbavuje je dalšího materiálu přidaného při jejich výrobě, balí je a pak je cíleně balí. Golgiho komplex je aktivní zejména při zpracování proteinů určených k sekreci. Golgiho komplex uvolňuje speciální enzymy zvané lysozomy, které odstraňují přebytečné aminokyseliny. Když je obal připraven, je odštípnut od Golgiho a uvolněn do cytoplazmy.

Golgiho komplex je součástí buněčného membránového systému, stejně jako endoplazmatické retikulum.