Tvar a struktura tykadel
Nejnápadnější rozdíl je v tykadlech. Většina motýlů má tenká štíhlá vláknitá tykadla, která jsou na konci tyčinkovitá. Naproti tomu můry mají často tykadla hřebínkovitá nebo péřová, případně vláknitá a neklubkovitá. Toto rozlišení je základem nejstaršího taxonomického dělení motýlů (Lepidoptera) - Rhopalocera ("paličkovité rohoviny", motýli) a Heterocera ("pestré rohoviny", můry).
Z tohoto pravidla však existují výjimky a několik můr (čeleď Castniidae) má tykadla kyjovitá. Někteří motýli, jako například Pseudopontia paradoxa z lesů střední Afriky, kyjovité konce postrádají. U motýlů rodu Hesperiidae je konec tykadla často zahnutý.
Mechanismy spojování křídel
Mnoho můr má křídelní spojku. Frenulum lze vidět pouze tehdy, když je exemplář v ruce. Existují různé typy. Může to být vlákno ze zadního křídla, které se spojuje s ostny na předním křídle. Motýli tyto struktury obvykle postrádají. Jejich křídelní spojka je obvykle tvořena prostým překrytím okrajů křídel.
Pupae
Většina housenek můr si při přechodu do kukelního stadia upřede kokon z hedvábí. Většina motýlů naopak vytváří odkrytou kuklu zvanou kukla.
Z tohoto pravidla existuje mnoho výjimek. Jestřábí můry tvoří odkrytou kuklu, která je pod zemí. Můry cikánské někdy vytvářejí kukly ve stylu motýlů, které visí na větvičkách nebo kůře stromů, i když obvykle vytvářejí slabé kokony z hedvábných vláken a několika listů, které částečně odhalují kuklu. Několik larev motýla skokana skřehotavého si také vytváří hrubé kokony, v nichž se kuklí a kukla je tak trochu odhalena. Larvy motýlů rodu Parnassius si ke kuklení vytvářejí chatrný kokon a kuklí se poblíž povrchu země mezi sutí.
Barva křídel
Většina motýlů má křídla pestře zbarvená. Noční motýli jsou naopak obvykle hnědí, šedí, bílí nebo černí a často mají na křídlech zakrývací vzory klikatek nebo vírů, které jim pomáhají maskovat se při denním odpočinku. Mnoho denních můr je však pestře zbarvených, zejména pokud jsou jedovaté. Několik motýlů je zcela nevýrazných, jako například bělásek zelný.
Struktura těla
Můry mají obvykle robustní a chlupaté nebo chlupaté tělo. Motýli mají naopak štíhlejší a hladší břicho. Můry mají na křídlech větší šupiny. Díky nim vypadají hustěji a chlupatěji. Motýli mají naopak šupiny jemné. Tento rozdíl je pravděpodobně způsoben tím, že můry musí během chladnějších nocí šetřit teplo, zatímco motýli jsou schopni absorbovat sluneční záření.
