Myko-heterotrofie je vztah mezi některými rostlinami a houbami. Rostlina získává veškerou nebo část své potravy parazitováním na houbách, nikoliv fotosyntézou.
V minulosti se předpokládalo, že nefotosyntetické rostliny získávají potravu rozkladem organických látek, jak to dělají houby. Takové rostliny se proto nazývaly saprofyty. To bylo špatně. Nyní je známo, že žádná rostlina není fyziologicky schopna přímého rozkladu organické hmoty.
Nefotosyntetické rostliny získávají potravu parazitismem, a to mykoheterotrofií nebo přímým parazitismem na jiných rostlinách.
Rozhraní mezi rostlinou a houbovým partnerem v této asociaci je mezi kořeny rostliny a myceliem houby. Myko-heterotrofie se tedy velmi podobá mykorhize a předpokládá se, že se vyvinula z mykorhizy.
