Pyrenejská unie byl stát, který vládl na Pyrenejském poloostrově v letech 1580-1640. Po válce o portugalské dědictví došlo ke spojení monarchií Portugalska a španělské větve habsburského rodu. Dynastická unie spojila koruny Kastilie, Portugalska a Aragonie spolu s jejich koloniálními panstvími pod vládu hispánské monarchie. Instituce, vláda a právní tradice jednotlivých království zůstaly na sobě nezávislé, pouze měly stejného krále, kterým byl španělský Habsburk. Cizinecké zákony (Leyes de extranjeria) určovaly, že příslušník jednoho království je ve všech ostatních iberských královstvích cizincem. Termín iberská unie se v té době nepoužíval, je výtvorem moderních historiků.
Panovníci dlouho usilovali o sjednocení penisuly: Měli na mysli visigótskou monarchii. Sancho III. navarrský a Alfonso VII. leónský a kastilský si již před staletími přisvojili titul Imperator totius Hispaniae, což znamená "císař celé Hispánie". Kdyby se králem stal Miguel da Paz (1498-1500), princ portugalský a asturský, mohlo být unie dosaženo dříve. Zemřel však v raném dětství.
Dějiny Portugalska od dynastické krize v roce 1578 do nástupu prvních panovníků z rodu Braganza byly obdobím přechodu. Na počátku tohoto období dosáhl obchod s kořením v portugalském impériu vrcholu. Vasco da Gama konečně dosáhl Východu, když v letech 1497-98 obeplul Afriku a dokončil tak objevitelské úsilí započaté Jindřichem Mořeplavcem. Tím se otevřela oceánská cesta pro výnosný obchod s kořením do Evropy, která obcházela Blízký východ.
V průběhu 17. století stále častější drancování a obkličování portugalských obchodních stanic na Východě Nizozemci, Angličany a Francouzi a jejich rychle rostoucí pronikání do obchodu s otroky v Atlantiku podkopávalo téměř monopol Portugalska na lukrativní oceánský obchod s kořením a otroky. Portugalský obchod s kořením se tak dostal do dlouhodobého úpadku. V menší míře způsobilo napětí v unii také odklonění bohatství z Portugalska habsburskou monarchií na podporu katolické strany třicetileté války, ačkoli Portugalsko mělo prospěch ze španělské vojenské síly, která pomohla udržet Brazílii a narušit nizozemský obchod. Tyto události a události, k nimž došlo na konci vlády dynastie Avizů a v období Pyrenejské unie, přivedly Portugalsko do stavu závislosti na svých koloniích, nejprve na Indii a poté na Brazílii.