Rod Braganza byl založen v roce 1442. Tehdy se Afonso, 8. hrabě z Barcelosu, stal vévodou z Braganzy. Alfonso (Alfonso I.) byl nemanželským synem portugalského krále Joãa I. z rodu Avizů. Vévodou ho učinil jeho synovec, portugalský král Afonso V. Alfonso I. se stal vévodou z rodu Avizů. Feudální vévodové rychle shromáždili bohatství v podobě majetku, titulů a moci. V polovině 16. století byl rod nejmocnější v celém Portugalsku. Patřil také k největším rodům na Pyrenejském poloostrově.
Rod Braganza se stal nejprve vládnoucím rodem Brazílie, když bylo v roce 1815 vytvořeno Spojené království Portugalska, Brazílie a Algarvů. Spojené království trvalo až do roku 1822, kdy se Brazilské císařství stalo nezávislým na Portugalsku. V čele nového brazilského státu stál princ Pedro z Braganzy, dědic portugalského trůnu, který vládl jako brazilský císař Pedro I. a také jako portugalský král Pedro IV. Až do roku 1835 byli portugalští Braganzové stále v nástupnické linii na brazilský trůn. Rod byl sesazen (odstraněn) z brazilského trůnu v roce 1889, kdy byla Brazílie vyhlášena republikou.
Rod byl až do roku 1921 uchazečem o brazilský trůn. Tehdy zemřela Isabel, brazilská princezna, dcera brazilského císaře Pedra II. Její nárok přešel na jejího syna, prince Pedra Henriqueho Orleánského a Braganzského. Tím se rod Orleánsko-Braganzský stal rodem uplatňujícím nárok na bývalou brazilskou monarchii. Pedro Henrique zemřel v roce 1981. Současným pretendentem je jeho nejstarší syn, princ Luiz.
V Portugalsku byl v roce 1908 zavražděn portugalský král Carlos I. Při útoku byl zabit také jeho nejstarší syn. Králem se stal jeho mladší syn Manuel II. Když byla v roce 1910 založena Portugalská republika, král Manuel II. a ostatní členové rodu Braganzů odešli do exilu.