Sir Joseph John "J.J." Thomson, OM, FRS (18. prosince 1856 - 30. srpna 1940) byl britský fyzik a nositel Nobelovy ceny. Objevil elektron a izotopy a vynalezl hmotnostní spektrometr. Nobelovu cenu za fyziku získal v roce 1906 za objev elektronu a práci o vedení elektřiny v plynech. John Joseph Thomson v roce 1893 řekl: Thomson v roce 1893 prohlásil: "Žádný jiný obor fyziky nám neposkytuje tak slibnou příležitost proniknout do tajemství elektřiny."
V roce 1897 Thomson prokázal, že katodové záření je tvořeno dosud neznámou záporně nabitou částicí, jejíž hmotnost je v porovnání s elektrickým nábojem velmi malá. Později byla nazvána elektronem a byla první objevenou subatomárníčásticí. V roce 1913 Thomson při studiu anodových paprsků (kladných kationtů) také poprvé prokázal existenci izotopů stabilních (neradioaktivních) prvků.
V atomové teorii vyslovil hypotézu, že atomy jsou koule rovnoměrně rozloženého kladného náboje, v nichž se nachází jednotlivý záporně nabitý elektron. Později dospěl k závěru, že v atomu je více než jedna záporně nabitá částice.
Mnozí z mladých mužů, kteří s ním studovali a pracovali na univerzitě v Cambridge, se stali slavnými fyziky.